(в комментариях все описано)
на всякий случай, повторюсь : При включении параллельного режима работы с Синодоидальной Библией - все в Толковой Библии съезжает на одну главу вперед. Исправите, пожалуйста. Или обьясните как.

Толковая Билия Лопухина, как и другие комметарии НЕ ПРЕДНАЗНАЧЕНЫ для просмотра в режиме прараллельной Библии.

Их надо размещать не в общую папку с модулями, а во вложенную паку Commentaries. При этом их сделать "параллельной Библией" вообще не получится, поскольку они не будут отображаться в списке. Если их загрузить в окно, то к ним какой -нибудь библейский модуль установить параллельным можно, но это баг, а не фича. Потому что будет не только сдвиг по главам (а, как правило, во всех комментариях есть "нулевая глава"), но и абзацы комментария не будут совпадать с библейскими стихами.

Как надо пользоваться ими на самом деле?

Все модули-коммментарии, пощённые в папку Commentaries, отображаются в раскрывающемся списке на вкладке "Комментарии" боковой панели. Просто выбираете нужный.

В этом режиме главы, как видите на скриншоте, совпадают. И при выборе модуля, и при переходе к новой главе. Чтобы быстро перейти к комментарию на нужный фрагмент главы, надо щёлкнуть по гиперссылке номера соответсвующего стиха (так же, как при вызове параллельных мест). Текст в окне комментария прокрутится к запрошенному месту.

Спасибо за ответ, но очень хотелось в параллельном режиме ею пользоваться вместе с Синодальным текстом. - так больше возможностей и быстрее.
Может можно в модуль Лопухина добавить пустую нумерацию глав для полной синхронизации, т.е., я заметил:

<h2>1</h2>

<p> <i>1–7. Умножение потомков Иакова в Египте. 8–22. Угнетение их новым фараоном.</i>
<p>1-6 Перечислением имен сынов Израилевых, вошедших в Египет, и упоминанием о смерти Иосифа Моисей отсылает читателя к последним главам кн. Бытия (46:8–27; 50:26 [1414]) и тем самым дает понять, что кн. Исход находится с ними в тесной связи. Подобно им, она имеет своим предметом описание жизни потомков Иакова в Египте, а начиная его с момента смерти Иосифа, является их продолжением. Перечисление сыновей Иакова — глав поколений ведется в порядке их матерей (Быт 35:23–26). В общее число переселившихся (Быт 46:27; Втор 10:22), большее в греко-славянском по сравнению с еврейским на пять ввиду того, что LXX переводчиков прибавляют троих внуков и двух правнуков Иосифа (Быт 46:20), не включены — жены сыновей Иакова (Быт 46:26) и другие, принадлежащие к патриархальной семье лица — рабы и рабыни (Быт 32:6). С присоединением этих последних, право на что дает выражение 1-го стиха «вошли каждый с домом своим», — с семейством, включая жен, детей, слуг (Быт 7:1), вообще с поколением (Исх 1:1; 1 Цар 20:16), — число вошедших в Египет справедливо увеличивают до нескольких сот. Смерть Иосифа и всего старого поколения отмечается, как начало нового, ниже описываемого периода в жизни семьи Иакова. Он характеризуется двумя чертами: усиленным размножением евреев и новыми отношениями к ним египтян.

а может сделать :

<h2>1</h2>

<p> <i>1–7. Умножение потомков Иакова в Египте. 8–22. Угнетение их новым фараоном.</i>
<p>1 Перечислением имен сынов Израилевых, вошедших в Египет, и упоминанием о смерти Иосифа Моисей отсылает читателя к последним главам кн. Бытия (46:8–27; 50:26 [1414]) и тем самым дает понять, что кн. Исход находится с ними в тесной связи. Подобно им, она имеет своим предметом описание жизни потомков Иакова в Египте, а начиная его с момента смерти Иосифа, является их продолжением. Перечисление сыновей Иакова — глав поколений ведется в порядке их матерей (Быт 35:23–26). В общее число переселившихся (Быт 46:27; Втор 10:22), большее в греко-славянском по сравнению с еврейским на пять ввиду того, что LXX переводчиков прибавляют троих внуков и двух правнуков Иосифа (Быт 46:20), не включены — жены сыновей Иакова (Быт 46:26) и другие, принадлежащие к патриархальной семье лица — рабы и рабыни (Быт 32:6). С присоединением этих последних, право на что дает выражение 1-го стиха «вошли каждый с домом своим», — с семейством, включая жен, детей, слуг (Быт 7:1), вообще с поколением (Исх 1:1; 1 Цар 20:16), — число вошедших в Египет справедливо увеличивают до нескольких сот. Смерть Иосифа и всего старого поколения отмечается, как начало нового, ниже описываемого периода в жизни семьи Иакова. Он характеризуется двумя чертами: усиленным размножением евреев и новыми отношениями к ним египтян.
<p>2
<p>3
<p>4
<p>5
<p>6

?

Но, во-первых тратить уйму время для каждого из многочисленных модулей комментариев на ручное осуществление того, что должна уметь программа (и умеет, но в несколько ином режиме) - мягко говоря, неэргономично.

Во-вторых, предлагаемый Вами режим использования, на самом деле - жутко неудобен. Представьте себе: половину ширины занимает короткий стих и пустое поле под ним, а половину - "длинное "полотенце" комментария...

Если Вы это считаете всё же удобным - никто не мешает Вам самому осуществить эту совместимость и поделиться исправленным модулем с другими.
Только делать это надо не так, как Вы описываете:

1. В biblequote.ini указать VerseSign=<v> (например)
2. Этот значок проставить
- во-первых, перед теми <p>, за которыми идут номера стихов
- во-вторых для "пустых" стихов соответственно их количеству. Номера стихов после них ставить не надо
И с том, и в другом случае <v> должен идти с начала строки (после виндовского начала абзаца, CrLf). Для пустых стихов после него обязательно должен идти пробел.

Все "нулевые главы" вам придётся тоже включить в состав первого стиха первой главы (а из biblequote.ini удалить строку ChapterZero=Y). То бишь таким вот образом:

<h2>1</h2>

<p> <b><u>Книга Исход</u></b>
<v><p> <b>Автор книги.</b> Автором книги Исход, как видно прежде всего из ее содержания, был Моисей. Так, после победы над амаликитянами он получает от Господа повеление записать это событие: <i>«напиши сие для памяти в книгу»</i> (Исх 17:14). Подобное же повеление дано было Моисею после восстановления нарушенного Израилем завета: <i>«И сказал Господь Моисею: напиши себе слова сии»</i> (34:27). Равным образом пред торжественным заключением завета после Синайского законодательства Моисей, пересказав народу все слова Господни и все законы, <i>«написал Моисей все слова Господни»</i> (24:4). О Моисее, как авторе книги Исход, свидетельствует и Иисус Христос в известных словах к саддукеям: <i>«о мертвых, что они воскреснут, разве не читали вы в книге Моисея, как Бог при купине сказал ему…»</i>. (Мк 12:26). Рассказ о явлении Бога Моисею при купине помещается в кн. Исход, и она-то является, по словам Спасителя, книгой Моисеевой. Конечно, выражение «книга Моисеева» может значить: книга, говорящая по преимуществу о Моисее или называющаяся по имени Моисея. Но подобное понимание не может иметь места, так как в кн. Исход Моисей не занимает главного места и в названии кн. его имя у евреев не упоминается. (....)

<p> <i>1–7. Умножение потомков Иакова в Египте. 8–22. Угнетение их новым фараоном.</i>
<p>1-6 Перечислением имен сынов Израилевых, вошедших в Египет, и упоминанием о смерти Иосифа Моисей отсылает читателя к последним главам кн. Бытия (46:8–27; 50:26 [1414]) и тем самым дает понять, что кн. Исход находится с ними в тесной связи. Подобно им, она имеет своим предметом описание жизни потомков Иакова в Египте, а начиная его с момента смерти Иосифа, является их продолжением. Перечисление сыновей Иакова — глав поколений ведется в порядке их матерей (Быт 35:23–26). В общее число переселившихся (Быт 46:27; Втор 10:22), большее в греко-славянском по сравнению с еврейским на пять ввиду того, что LXX переводчиков прибавляют троих внуков и двух правнуков Иосифа (Быт 46:20), не включены — жены сыновей Иакова (Быт 46:26) и другие, принадлежащие к патриархальной семье лица — рабы и рабыни (Быт 32:6). С присоединением этих последних, право на что дает выражение 1-го стиха «вошли каждый с домом своим», — с семейством, включая жен, детей, слуг (Быт 7:1), вообще с поколением (Исх 1:1; 1 Цар 20:16), — число вошедших в Египет справедливо увеличивают до нескольких сот. Смерть Иосифа и всего старого поколения отмечается, как начало нового, ниже описываемого периода в жизни семьи Иакова. Он характеризуется двумя чертами: усиленным размножением евреев и новыми отношениями к ним египтян.
<v>
<v>
<v>
<v>
<v>
<v><p>7 О размножении евреев говорит и еврейское выражение «ваишрецу» — стали кишеть, подобно быстро размножающимся мелким животным (Быт 1:20)

Тогда модулем можно будет пользоваться и в нормальном режиме и в том, который предлагаете Вы (мне он, уж извините, кажется извращённым, по причинам, изложенным выше). Предлагаемый же Вами вариант угробит его для нормальной работы.

Если Вы согласны потратить уйму времени на работу, которую я считаю бессмыссленной, а потому никогда за неё не возьмусь (помня сколько времени и сил стоил мне сам этот модуль) - то благословение Господне на Вас в этом нелёгком труде. Уверен, у Вас найдутся единомышленники, которые будут Вам за него благодарны. А я его с удовольствием выложу (если он будет отвечать указанным требованиям, то есть корректно работать и в режиме комментария).

Куда как проще кинуть модуль в папку Commentaries...

Бог в помощь, Олег!
И как это только тебя на все хватает?

Но модули классные, надеюсь, продолжаться будут?!